Sybase IQ 12.6 GA 版本开始支持对数据库文件进行强加密以增强安全性。强加密通过 128 位算法和安全密钥实现。没有密钥，数据将无法读取，实际上不可解密。美国联邦信息处理标准中的高级加密标准 (FIPS-197) 说明了受支持的算法。
Sybase IQ 12.7 版本增加了 AES_ENCRYPT 和 AES_DECRYPT 函数以及 LOAD TABLE ENCRYPTED 子句以支持用户加密的列。这些函数支持对列数据进行显式加密和解密（通过应用程序调用）。加密和解密密钥的管理由应用程序负责。