利用粗糙集算法及其工具Rosetta软件,建立了一种RNA保守功能二级结构预测方法。该方法通过数据挖掘,从整理和离散化的RNA碱基对数据中生成规则,从而确定保守二级结构中的碱基对。在HIV病毒REV应答元件单元保守二级结构预测中,粗糙集方法比传统算法预测的结构与野生型更相似,功能结构分支更清晰。